熊本市では、地域ごとに通学できる小中学校を指定している。その小学校の通学区分が、小学校区「校区」として取り扱われる場合が多い。

熊本市の小学校、中学校のほとんどは市立である。そのそれぞれの地区に複数の学校があるときには、一般に学校ごとに校区を定め、それぞれの住民が入学、通学できる学校は1校に限定されるのが普通である。しかしながら、地区によっては2校区にまたがる区域もあり選択が可能な場合もある。

ほとんどの場合、その校区住民以外はその学校に入学、通学することができないことが多い。